Az Endoszkópos Szekció a Magyar Gasztroenterológiai Társaság legnagyobb létszámú és legaktívabb szekciója, amely tevékenységét jól mutatja az éves nagygyűléseken való részvételen túl, a számos önálló rendezvény, a továbbképző tréningek, a nemzetközi konferenciák szervezése. A szekció vezetőségének és a tagok munkájának elismerését jelzi, hogy rangos nemzetközi endoszkópos konferenciákat sikerült hazánkba hozni, illetve a szekció tagjai rangos nemzetközi kongresszusokon (ESGE) szerepelnek felkért előadóként, endoszkópos vizsgálóként.

A Szekció célja az endoszkópos ellátását végző szakemberek, egészségügyi ellátó helyek szakmai és tudományos tevékenységének megismerése, segítése, fejlesztése beleértve a hazai és nemzetközi kapcsolatokat, tapasztalatcserét is.

Ennek megvalósításához a Szekció feladatának tekinti:

• az endoszkópiával foglalkozó, elkötelezett fiatal szakemberek képzésének, tudományos tevékenységének támogatását;
• korszerű endoszkópos technikák megismertetését, hazai meghonosításának elősegítését;
• az endoszkópos ellátásban résztvevő szakemberek képzését, továbbképzését, az egyes endoszkópos modalitásokra vonatkozó szakmai útmutatók, állásfoglalások kidolgozását;
• együttműködést az ellátórendszert működtető mindenkori finanszírozó és döntéshozó szervezetekkel a betegellátás színvonalának, illetve az endoszkópiával foglalkozó egészségügyi személyzet megbecsültségének és szakmai tevékenységének javítása érdekében;
• interdiszciplináris kapcsolatok feltárását és fejlesztését
• kapcsolat tartását hasonló célú nemzeti és nemzetközi szervezetekkel.

A Szekció a célok megvalósítása érdekében

• tudományos rendezvényeket szervez, melyek közül kiemelkedő az évente megrendezett tudományos ülés;
• szakmai ajánlásokat, irányelveket, finanszírozási javaslatokat készít;
• internetes honlap működtetésével segíti az egyes munkahelyek és az endoszkópos szakemberek tájékoztatását;
• az önálló endoszkópos vizsgálat végzéséhez követelményrendszer dolgoz ki
• támogatja, illetve együttműködik az endoszkópos asszisztensi szekcióval.